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Synthego 最新发布:强大的 CRISPR 分析软件, 使世界一流基因组编辑工程触手可及——ICE为您提供高通量、NGS品质的CRISPR编辑分析

人阅读 发布时间:2018-03-05 16:18

2018 年 1 月 29 日,加州雷德伍德城——Synthego,一家领先的基因组工程解决方案提供公司,于当日宣布推出 ICE 软件。这是一个强大的名为「Inference of CRISPR Edits」的新工具,能够对 Sanger 数据进行快速的、具有可重复性的分析,且比 NGS 成本低 100 倍。ICE 是免费使用并且开放源码的,也是唯一能批量处理 Sanger 数据的 CRISPR 分析软件。

根据 2017 年 BioInformatics 发布的 CRISPR/Cas9 基因组编辑产品市场分析报告来看,80% 被调查者认为目前 CRISPR 工作流程中最为紧迫的挑战,即是校验基因组编辑结果。

“CRISPR 研究的快速进展需要可靠的工具辅助,这些工具必须简便易用、成本效益高、结果稳定可靠。” Synthego 公司合成部门负责人 Kevin Holden 博士说:“我们的 ICE 软件将为所有 CRISPR 研究人员提供高质量的基因编辑分析。”

在 ICE 出现之前,快速廉价的 CRISPR 编辑结果分析,是研究人员需要面对的巨大挑战。NGS 是基因组编辑分析的金标准,但是 NGS 的高成本和耗时成为 CRISPR 工作的巨大瓶颈。其它方法速度较快,但是缺少质量和结果一致性的保证。

Holden 博士继续说:“ICE 是很直观直接的,在几秒钟内就能通过 Sanger 测序数据获得 NGS 质量等级的结果。”

ICE 的界面易于使用。它提供了插入和缺失(indel)的百分比,indel 的出现率以及与野生型基因序列的不一致性对比,且同时可以分析几百个样品。

“ICE 不仅能比其它算法提供更准确可靠的 indel 数据,而且还能迅速生成发表级别的 indel spectrum 和 Sanger traces。” 斯坦福大学 Porteus Lab 的研究讲师 Daniel Dever 博士说:“ICE 具有成为 CRISPR 分析标准的潜力。”

“我们研发 ICE 是用来支持我们内部的复杂分析需求”,Synthego 公司的科研首席负责人 Rich Stoner 博士说:“我们现在将它免费发布在网络上作为开源工具,让广大的 CRISPR 研究人员能够获得快速且稳定的编辑结果分析。”

ICE 成为 Synthego 迅速增长的 CRISPR 大家庭中的一员,与 CRISPRevolution 合成 guide RNA 系列一起,为各地的 CRISPR 研究人员提供点对点 (end-to-end) 的解决方案。

想了解更多关于发表在 bioRxiv 上的「Inference of CRISPR Edits from Sanger Trace Data」,请访问 https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/20/251082,免费使用 ICE ice.synthego.com

关于 Synthego

Synthego 是一家领先的提供基因组工程解决方案的公司。公司产品组合包括一系列应用于 CRISPR 基因组编辑和研究的合成 RNA 试剂盒以及软件。在二代信息学和机器学习的基础上,Synthego 公司的愿景是为基因组工程带来精准且自动化的服务,帮助每位科学家获得快速便捷、持续高效的研究结果。

总部位于硅谷的 Synthego 公司,其客户遍及世界上 32 个国家的高端学府、世界十大生物技术公司其中的 8 家,以及全球生物研究前 25 所大学中的 24 所。想要了解更多关于 Synthego 公司的信息,请访问 www.synthego.com

北京赛百盛基因技术有限公司是 Synthego 公司在中国的代理,若有任何问题请致信 service@sbsbio.com
 

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